把一個名字問清楚

1ME_R、ME(R)、optic medulla，是三塊腦區還是一塊？

一塊。你讀一篇用 FlyWire 資料的論文，裡面的腦區叫 ME_R；換一篇用 hemibrain 的，同一塊叫 ME(R)；再翻一本解剖學的書，它叫 optic medulla。三個寫法指的是同一塊神經氈——那是 PART 1 用的詞，指神經纖維密集交織、突觸集中的那一團組織；這一塊位在視葉，也就是果蠅腦處理視覺的那一大區。

這件事聽起來只是麻煩，實際上會讓整個分析停擺：你想把兩套連線資料放在一起比，第一步就要知道甲方的 ME_R 等於乙方的哪一個。多數人的作法是自己維護一張對照表。VFB 的作法是，那張表已經在裡面了。

在 VFB 上，這塊腦區只有一個身分，編號 FBbt_00003748，正式名字是 medulla。上面那三個寫法，連同另外五種，全部登記成它的別名——也就是「同一個東西的另一種寫法」：

上表整理自 out/terminfo_region.json 的 Synonyms（scripts/vfb_probe.py 抓取，2026-09-14）。同一份內容在畫面上是 Term Info 的 Alternative Names 欄，逐列存在 out/ui/terminfo_v2_region.json（scripts/browser_probe.py 拍攝，2026-09-14）：兩邊都是 13 列，畫面上每一列還附了出處論文。表裡的八種寫法就是這 13 列去掉重複登記的結果——ME_R、ME_L、ME(R)、ME(L) 各被不只一套資料集登記過一次。

2VFB 查的是詞，不是字串

VFB 底下掛著一份本體論——這個詞本課第一次用，先定義：本體論是一份把概念、概念的正式名字、它的別名、以及概念與概念之間的關係（哪個是哪個的一部分、哪個是哪個的一種）全部寫下來的詞表，每個概念配一個永久編號。VFB 用的那一份叫 FBbt，是 FlyBase 維護的果蠅解剖本體論，前面那個 FBbt_00003748 就是它的編號。

「查詞不查字串」的直接後果是：同一個詞會在結果裡佔不只一列。向 VFB 的公開介面查 medulla、要 10 筆，回來的 10 列對應的其實只有 9 個詞——FBbt_00003748 佔了兩列：

讀法是這樣：括號外面是配對到的那個寫法，括號裡面是這個詞的正式名字或編號。第一列是拿正式名字配對到的，所以括號裡直接給編號；第二列是拿別名 optic medulla 配對到的，所以括號裡提醒你「它的正式名字是 medulla」。兩列，一個詞。

上表出自 out/search_medulla.json（scripts/vfb_probe.py，2026-09-14），該檔存的是完整的 10 列；表上只列出前四列與重複的那一組。

3兩種編號是兩種東西：類別與個體

你在 VFB 上會看到兩種編號開頭，它們不是新舊版本，是兩種不同性質的東西：

把同一塊腦區的兩邊並排，差別一眼看得出來：

一個類別底下有幾個個體

medulla 這個類別，知識庫（VFB 背後存放所有資料的那個資料庫，PART 1 第 3 節這樣叫它）裡掛著 2,424 個個體。其中有名字的只有 12 個，另外 2,412 個的編號長成 VFB_internal…、沒有名字也沒有影像——那些是用來承載「某一個基因表現模式，跟某一隻果蠅的這塊腦區有重疊」這類陳述的節點。

有名字的 12 個裡，只有 4 個有影像，就是 medulla 被畫在四套標準腦上的那四塊；剩下 8 個是 ME_L、ME_R、ME(L)、ME(R) ——四套連線資料集各自登記的左右兩塊。

整個知識庫的尺度也是同一個道理：登記在案的東西共 741,026 個，其中類別 122,360 個、個體 618,665 個。個體比類別多五倍，因為同一個概念會被畫在很多顆腦上、被很多套資料集各自登記一次。

並排表的欄位與值，出自 out/ui/terminfo_v2_region.json（類別那一欄）與 out/ui/terminfo_v2_individual.json（個體那一欄）——兩支都是 scripts/browser_probe.py 在 2026-09-14 用真的瀏覽器拍的。個體數出自 out/terminfo_individual.json（該檔的個體數用知識庫的 Cypher 查詢算，不是用介面的 Examples 欄——那一欄實測不穩定，同一個編號連問五次會交替回三套與四套）。有影像的 4 個出自 out/counts_region.json 的 ListAllAvailableImages。全站三個總數出自 out/facets.json。以上皆由 scripts/vfb_probe.py 於 2026-09-14 抓取。全站總數會隨資料更新而變，這裡標出來是要給你一個量級，不是一個常數。

4同一個東西有三個名字

在檢視器（virtualflybrain.org/reports/<編號> 會帶你到那裡）打開任何一個東西的 Term Info 面板，你會看到三個欄位，三個都是它的名字：

十套 template 裡，有五套的 Symbol 跟 Name 不一樣；其中三套的 Symbol 連一個字都不出現在 Name 裡——拿著其中一個去站上找另一個，會找不到：

十套的 Name 與 Symbol 出自 out/template_names.json（scripts/vfb_probe.py，2026-09-14）。三個欄位在畫面上的位置與寫法，出自 out/ui/terminfo_v2_template.json 與 out/ui/terminfo_v3_template.json（scripts/browser_probe.py 拍攝，2026-09-14）。

5三個搜尋框，三種行為

VFB 有三個網站，各有一個搜尋框。它們不是同一個東西換了個樣子——送出去的查詢就不一樣。同一個字 medulla，三個框送出三種東西：

1,466 跟 506 這種數字，是兩層放大疊出來的。以 v3 為例：

1. 查詢被展開成萬用字元。你打 medulla，送出去的是「medulla 或 medulla 開頭 或 任何位置含 medulla」，所以 medulla columnar neuron、accessory medulla 這種全部符合，共 501 個詞。
2. 拿回來的每個詞，再按別名拆開。實際取回 150 個詞，畫面上卻排出 506 列：medulla 這一個詞，就因為 m、ME、Med、optic medulla 各自被拆成一列。

三個框送出的查詢與畫面列數，由 scripts/browser_probe.py 用真的瀏覽器各操作一次取得（2026-09-14），原始輸出在 out/ui/palette.json、out/ui/search_v2.json、out/ui/search_v3.json；每一支都附了它攔到的完整查詢網址，以及拿那個網址重問一次得到的詞數，兩者並排存著。

6打 JRC2018Unisex 找不到 JRC2018Unisex

把前面幾節合起來，就解得開這門課最反直覺的一個現象。到說明文件站的搜尋框，打上這顆標準腦的正式名字 JRC2018Unisex——完全正確、一個字不差——畫面給你 8 列，每一列都長成 ME on JRC2018Unisex adult brain 這樣，而 JRC2018Unisex 本身不在裡面。

五件事疊在一起，缺一件都不會發生：

第 ③ 件事的差距不是勉強落敗：同一組條件、同一個字串，只差大小寫——

該打什麼才找得到

打 JRC2018U。那是它的 Symbol（第 4 節那張表的第一列）。用它去查，符合的只有一個，畫面上就一列，正是要找的那顆標準腦。

名次與分數出自 out/search_case.json（scripts/vfb_probe.py，2026-09-14，兩種大小寫各問一次）。「要 40 筆、顯示 8 列」與各種打法的結果出自 out/worksheet.json 的 docsite_search_box。「送出前一律轉小寫」與畫面上那 8 列的內容，出自 out/ui/palette.json——那一支是用真的瀏覽器打字、攔下送出的查詢、再把畫面上的列逐列記下來的（scripts/browser_probe.py，2026-09-14）。

7動手做

四步，不用安裝也不用登入。前三步都直接給網址，貼到瀏覽器就會開在 VFB 的檢視器（v2.virtualflybrain.org）裡。

1. 打開 medulla 這個「類別」。網址：virtualflybrain.org/reports/FBbt_00003748。
   去哪裡確認你到對地方了：檢視器裡的 Term Info 分頁，看它的 Name 欄，應該寫著 medulla [FBbt_00003748]（編號在方括號裡）。
2. 找出這塊腦區的所有別名。在同一個 Term Info 面板裡往下找 Alternative Names 欄。
   看到什麼算對：每一列都寫成「某某 synonym：寫法（出處）」，例如 exact synonym: ME (BRAIN_NAME_ABV, Ito et al., 2014)。找出 第 1 節那張表裡的 ME_R，確認它旁邊標的是 BANC 與 FlyWire 兩套資料。
3. 換成同一塊腦區的「個體」，比較兩邊的面板。網址：virtualflybrain.org/reports/VFB_00102107。
   去哪裡看：一樣是 Term Info。看到什麼算對：這一頁有三個上一頁沒有的欄位——License（寫著 CC-BY-NC-SA_4.0）、Source（寫著 JRC 2018 templates & ROIs）與 Aligned To（寫著 JRC2018U，是短名不是編號）；而上一頁有的 Alternative Names，這一頁沒有。這就是第 3 節那張並排表，在畫面上的樣子。
   順便看一下 Classification 欄：它寫著 medulla，也就是上一步那個類別——個體會指回自己的類別，你可以從這裡走回去。
4. 把同一個字丟進兩個不同的搜尋框。先到說明文件站 www.virtualflybrain.org，點頁首那顆 Search VFB… ⌘K 按鈕，打 medulla；再到 v3.virtualflybrain.org，用頂列的 Find something... 打同一個字。
   看到什麼算對：兩邊排出來的清單長度差很多，而且兩邊的第一列都是 medulla (FBbt_00003748)。第 5 節解釋了為什麼長度會差這麼多——但不管差多少，那個編號是同一個，而編號才是你要的東西。

這一節指名的每一個欄位名與它的現值，都由 scripts/browser_probe.py 在 2026-09-14 用真的瀏覽器把這四步做過一遍拍下來，原始輸出在 out/ui/（terminfo_v2_region.json、terminfo_v2_individual.json、palette.json、search_v3.json）。