離體全腦製備（ex vivo brain explant）

把果蠅的整顆腦取出，泡在持續供氧或灌流的養液裡，在顯微鏡下一邊刺激、一邊記錄神經元。 好處是能用藥物或外加通道精準控制「氣味訊號」與「多巴胺」各在何時出現；代價是沒有真實的氣味與行為，腦的自發活動也和活果蠅不同。相對的做法是在體（in vivo）：活果蠅頭部固定、打開腦殼記錄。

本頁用語（每頁可單獨查閱，故重複列出）：

• 蘑菇體、KC、葉、區室：蘑菇體（mushroom body）是果蠅腦中把氣味和好壞經驗連起來的構造；代表氣味的 Kenyon 細胞（KC）把軸突成束排成幾條「葉」，每條葉沿長度切成一格一格的「區室」（例如 γ1pedc、γ4、α1），細胞以所在區室命名（見 e-mushroom-body、c-mb-compartment）。
• 常見詞：PAM／PPL1＝兩群多巴胺神經元（DAN），分別多傳遞獎賞／懲罰；光遺傳＝讓神經元帶上照光就放電的蛋白（e-cschrimson）；離體＝把腦取出泡在養液裡，活體＝活果蠅固定後看腦；順向配對＝氣味先、多巴胺後，逆向＝多巴胺先；「未配對」＝兩種刺激錯開、不同時出現；cAMP＝多巴胺受體被活化後在細胞內產生的訊號小分子；※ 推論＝本庫推得、原文沒明說，？待查＝要靠其他資料確認。
• KC、DAN、MBON：Kenyon 細胞（代表氣味）、多巴胺神經元、蘑菇體輸出神經元（見 e-kenyon-cell、e-dopaminergic-neuron、e-mbon）。
• 乙醯膽鹼：嗅覺訊號傳給 KC 時用的化學物質；在取出的腦上滴它，等於「假裝聞到氣味」。
• 離子導入：用電流把藥從玻璃細針推出。
• P2X2＋ATP、CsChrimson：讓選定神經元遇 ATP 或紅光就放電的兩種外加通道（見 e-p2x2、e-cschrimson）。
• ΔF/F0、ΔR/R0：螢光（或兩色比值）相對刺激前的變化比例。

怎麼算 / 怎麼判定

不是一個量，而是一種製備；判定一篇是否「用」它，看它的結論是否在取出的腦上量得。本庫有三類用途：(1) 以乙醯膽鹼模擬氣味、以藥物或 P2X2 模擬多巴胺，量 KC 內訊號或 KC→MBON 突觸；(2) 以光或 ATP 活化一群細胞、看另一群有沒有反應，測功能連結；(3) 當對照，看活體中的某個樣式在離體時是否消失。

庫內的用法

參數見 numbers。

引用時的陷阱

1. 離體腦的狀態與活體不同。 Cohn 2015 指出離體時 DAN 的自發活動大幅減少，正是它用來解釋「分區樣式消失」的理由；所以在離體量到的突觸規則，起點狀態可能與活果蠅不同。
2. 刺激是人工的。 乙醯膽鹼的劑量與時長不等於真實氣味；Tomchik 2009 依反應調整噴射壓力與位置，各腦劑量不可比。Cohn 2015 主文沒寫 ATP 噴注的時長與壓力（？待查），與 Handler 2019 的 DAN 刺激強度無法比較，見 syn-contradictions 1.3。
3. 「活化 A，B 有反應」不等於直接相連。 Felsenberg 2017、2018 與 Cohn 2015 的連結實驗都沒有區分單突觸與多突觸，也沒有氣味。
4. 離體 n 常很小（Felsenberg 2017 為 4、5 筆；Felsenberg 2018 為 5 腦）。
5. 同類製備、不同結果要先比參數。 Cohn 2015 與 Handler 2019 同實驗室、同 γ4 MBON、同 P2X2 製備，對「未配對的多巴胺」得到不同圖像（1.3），不在本頁裁決。

相關

• 概念：c-whole-cell-patch-clamp、c-presynaptic-calcium、c-us-substitution、c-kc-mbon-plasticity
• 實體：e-p2x2、e-cschrimson、e-gcamp、e-epac-camp-sensor
• 主題：t-dopamine-to-plasticity、t-mbon-dan-feedback；矛盾：syn-contradictions
• 來源：s-tomchik-2009-camp-dynamics、s-cohn-2015-coordinated-neuromodulation、s-handler-2019-dopamine-receptor-timing、s-felsenberg-2017-re-evaluation、s-felsenberg-2018-memory-extinction