c739-GAL4 驅動品系(c739-GAL4)
本頁用語(每頁可單獨查閱,故重複列出):
- 蘑菇體(mushroom body):果蠅腦中把氣味和好壞經驗連起來的構造。代表氣味的 Kenyon 細胞(KC)把軸突成束排成幾條「葉」(α、α′、β、β′、γ),每條葉沿長度切成一格一格的「區室」(例如 γ1pedc、γ2、α1);細胞以所在區室命名。見 e-mushroom-body、c-mb-compartment。
- DAN、PAM、PPL1:多巴胺神經元(dopaminergic neuron)送出代表懲罰或獎賞的多巴胺;PAM 群多傳遞獎賞,PPL1 群(Handler 2019 寫作 PPL)多傳遞懲罰。
- MBON:蘑菇體輸出神經元,接收 KC 的訊號、推動果蠅靠近或走開;學習改變的是 KC→MBON 突觸的強弱。
- CS+/CS−、順向/逆向:訓練時配了糖、電擊或 DAN 活化的氣味(CS+),與沒配的對照氣味(CS−)。順向配對=氣味先、多巴胺後;逆向配對=多巴胺先、氣味後。
- PI(表現指數)、LI(學習指數):行為分數。一群果蠅在兩種氣味間選擇,換算成一個數;多數篇落在 −1 到 +1(Hige 2015 的刻度不同),0=沒有偏好,正負號的意思各篇不同(見 c-performance-index)。
- 消退、再鞏固:學會後再聞 CS+ 卻沒有糖或電擊,學到的反應減弱,叫消退(c-memory-extinction);記憶被叫出來後暫時變得不穩定、再重新存好,叫再鞏固(c-memory-consolidation)。
- 驅動品系:讓外加基因只在選定神經元表現的果蠅品系。GAL4 與 LexA 是兩套互不干擾的開關;split-GAL4 把 GAL4 拆成兩半(AD 與 DBD),兩半都在的細胞才有作用(e-split-gal4)。基因型寫「X/+」表示只帶一個品系的對照組。
- 活化與阻斷工具:CsChrimson 照紅光讓神經元放電(e-cschrimson);P2X2 遇到 ATP 讓神經元放電(e-p2x2);shibire^ts1(shi)升溫時暫時關掉神經元的輸出(e-shibire-ts),全程維持低溫的「允許溫度對照」用來排除品系本身的效果。
- 讀數與製備:ΔF/F0=螢光相對刺激前基線的變化比例(0.5=亮了 50%),以遇鈣變亮的 GCaMP 量神經元活動(e-gcamp);離體=把腦取出泡在養液裡做實驗(c-ex-vivo-explant),活體=活果蠅固定後打開頭殼看。
- 標記:※ 推論=本庫推得、原文沒明說;?待查=要靠其他資料確認;「從圖判讀」=從圖上估讀的值;「text.txt 第 N 行」=本庫保存的論文全文文字檔的行號;「該頁」指表格同一列的來源頁。
是什麼
一個讓外加基因只在 α/β 型 Kenyon 細胞(e-kenyon-cell,軸突走 α 葉與 β 葉的那一類 KC)表現的驅動品系(驅動品系的原理見 e-split-gal4)。它是一般的 GAL4,不是 split-GAL4;Ichinose 2015 說它以「增強子陷阱」(enhancer trap,一種製作驅動品系的方法)得來。本庫兩篇都用它代表「α/β KC」,但一篇用它看細胞內的訊號分子,另一篇用它關掉這群細胞或降低其中的受體。
版本與規模
| 來源 | 搭配的效應基因 | 對照品系 |
|---|---|---|
| Tomchik 2009 | UAS-Epac1-camps(cAMP 感測器,見 e-epac-camp-sensor);這一組改用插在第 3 號染色體的另一個感測器轉基因品系 | 同篇另以 238Y(三類 KC)、c305a(α′/β′)、1471(γ)標其他 KC |
| Ichinose 2015 | UAS-shibirets1(e-shibire-ts);UAS-DopR1-RNAi | 第二個 α/β KC 品系 MB008B(split-GAL4)並用 |
庫內誰用了它
| 來源 | 用來做什麼 | 得到什麼 |
|---|---|---|
| s-tomchik-2009-camp-dynamics | 離體腦中量 α/β KC 軸突(α 葉)與樹突(萼部)的 cAMP | 乙醯膽鹼+多巴胺配對約為兩者單獨相加的 1.25 倍(協同較 238Y 的約 1.53 小);多巴胺在葉部可靠地提高 cAMP,在萼部有升有降(見 c-coincidence-detection) |
| s-ichinose-2015-reward-recurrent-circuit | 訓練時、訓練後 1 h 關掉 α/β KC 的輸出;在 α/β KC 降低多巴胺受體 DopR1(e-dopamine-receptor) | 訓練時阻斷:24 小時記憶約 0.15,對照約 0.42、0.44(n=7);訓練後 1 h 阻斷剩約 15%;降低 DopR1 後 LTM 約 0.13,對照約 0.43–0.53(皆圖判讀;見 c-memory-consolidation) |
數值見 numbers。
已知的問題
- 「α/β KC」是品系的標記範圍。 涵蓋多少顆、是否漏標或多標到別的細胞,兩篇正文都沒有給數字:?待查。Ichinose 用 MB008B 重做是為了互相印證;兩個品系方向一致,但損害幅度不同(訓練時阻斷 c739 約 0.15、MB008B 約 0.26)。
- 樣本數不平衡。 Ichinose 2015 圖 7B 的 c739 兩組 n=7,MB008B 兩組 n=18–19,同樣的星號背後效果大小不同。
- 同一品系的對照值批次間差很多:c739/+ 在 Ichinose 圖 9E 約 0.58、圖 9F 約 0.44。
- Tomchik 的 c739 組同時換了驅動品系與感測器插入位置,用來排除插入位置造成的假象;協同方向一致、幅度較小。