MB504B 驅動品系(MB504B split-GAL4)
本頁用語(每頁可單獨查閱,故重複列出):
- 蘑菇體(mushroom body):果蠅腦中把氣味和好壞經驗連起來的構造。代表氣味的 Kenyon 細胞(KC)把軸突成束排成幾條「葉」(α、α′、β、β′、γ),每條葉沿長度切成一格一格的「區室」(例如 γ1pedc、γ2、α1);細胞以所在區室命名。見 e-mushroom-body、c-mb-compartment。
- DAN、PAM、PPL1:多巴胺神經元(dopaminergic neuron)送出代表懲罰或獎賞的多巴胺;PAM 群多傳遞獎賞,PPL1 群(Handler 2019 寫作 PPL)多傳遞懲罰。
- MBON:蘑菇體輸出神經元,接收 KC 的訊號、推動果蠅靠近或走開;學習改變的是 KC→MBON 突觸的強弱。
- CS+/CS−、順向/逆向:訓練時配了糖、電擊或 DAN 活化的氣味(CS+),與沒配的對照氣味(CS−)。順向配對=氣味先、多巴胺後;逆向配對=多巴胺先、氣味後。
- PI(表現指數)、LI(學習指數):行為分數。一群果蠅在兩種氣味間選擇,換算成一個數;多數篇落在 −1 到 +1(Hige 2015 的刻度不同),0=沒有偏好,正負號的意思各篇不同(見 c-performance-index)。
- 消退、再鞏固:學會後再聞 CS+ 卻沒有糖或電擊,學到的反應減弱,叫消退(c-memory-extinction);記憶被叫出來後暫時變得不穩定、再重新存好,叫再鞏固(c-memory-consolidation)。
- 驅動品系:讓外加基因只在選定神經元表現的果蠅品系。GAL4 與 LexA 是兩套互不干擾的開關;split-GAL4 把 GAL4 拆成兩半(AD 與 DBD),兩半都在的細胞才有作用(e-split-gal4)。基因型寫「X/+」表示只帶一個品系的對照組。
- 活化與阻斷工具:CsChrimson 照紅光讓神經元放電(e-cschrimson);P2X2 遇到 ATP 讓神經元放電(e-p2x2);shibire^ts1(shi)升溫時暫時關掉神經元的輸出(e-shibire-ts),全程維持低溫的「允許溫度對照」用來排除品系本身的效果。
- 讀數與製備:ΔF/F0=螢光相對刺激前基線的變化比例(0.5=亮了 50%),以遇鈣變亮的 GCaMP 量神經元活動(e-gcamp);離體=把腦取出泡在養液裡做實驗(c-ex-vivo-explant),活體=活果蠅固定後打開頭殼看。
- 標記:※ 推論=本庫推得、原文沒明說;?待查=要靠其他資料確認;「從圖判讀」=從圖上估讀的值;「text.txt 第 N 行」=本庫保存的論文全文文字檔的行號;「該頁」指表格同一列的來源頁。
是什麼
MB504B 是一個 split-GAL4 驅動品系,讓外加基因只在 PPL1 群(傳遞懲罰的那群多巴胺神經元,DAN)中的幾型表現。 split-GAL4 把開啟基因的 GAL4 拆成兩半,各由一段調控序列控制,兩半都在的細胞才有作用(見 e-split-gal4)。依 Handler 2019 的基因型表,MB504B 的兩半是 52H03-p65.AD 與 TH-Gal4.DBD(TH 是合成多巴胺所需酵素的調控序列)。本庫三篇用它:一篇用來活化 PPL1、兩篇用來阻斷。
版本與規模(它標到誰)
| 來源 | 怎麼描述 |
|---|---|
| Handler 2019 | 「支配蘑菇體六個區室的一部分 PPL 神經元」(text.txt 第 196–197 行);沒列是哪六個 |
| Felsenberg 2017 | 延伸圖 6c:四型 PPL1——PPL1-γ1pedc(MB-MP1)、PPL1-γ2α′1(MB-MV1)、PPL1-α′2α2(MB-V1)、PPL1-α3 |
| Felsenberg 2018 | 「獲得嫌惡記憶所必需」的 PPL1 群;沒列型別 |
※ 推論:Felsenberg 2017 的四型,名稱裡的區室恰好是 γ1pedc、γ2、α′1、α′2、α2、α3 六個,可能就是 Handler 說的「六個區室」;但兩篇都沒有這樣對照,而且 γ1pedc 算一格還是兩格(γ1 與 pedc),來源之間也不一致(見 s-aso-2016-dan-cell-type-rules 對區室計數的討論)。
庫內誰用了它
| 來源 | 接上什麼 | 用來做什麼 |
|---|---|---|
| s-handler-2019-dopamine-receptor-timing | CsChrimson | 行為:以光活化 PPL,與氣味依不同時間差配對,量果蠅之後追氣味的變化 |
| s-felsenberg-2017-re-evaluation | shi^ts1 | 糖獎賞記憶再聞 CS+ 時阻斷:消退被部分擋住(PI 約 0.13,見該來源頁 3.1 節);再聞 CS− 時阻斷:記憶喪失 |
| s-felsenberg-2018-memory-extinction | Shi^ts1 | 嫌惡記憶再暴露期間阻斷:消退照常(圖 1D) |
數值見各來源頁與 numbers。
已知的問題
- 一個品系=四型 DAN 一起動。 讀到「阻斷 MB504B」時要記得是四型 PPL1 同時被關;Felsenberg 2017 逐一阻斷單一型時,消退都不受影響。
- PPL 與 PPL1 是不是同一群。 Handler 寫 PPL、Felsenberg 兩篇寫 PPL1,但三篇用的是同一個品系名,這讓「指同一群」的說法有了品系上的依據;見 syn-contradictions 4.4(部分解決)。Felsenberg 2017 延伸圖 6b 另列支配蘑菇體的 PPL1 共六型(多了 PPL1-γ1 與 PPL1-α′3),MB504B 沒標這兩型。
- 兩個記憶方向、兩種結果。 同一個品系,阻斷時對獎賞記憶的消退有影響(Felsenberg 2017),對嫌惡記憶的消退沒有影響(Felsenberg 2018)。這是不同實驗的不同結論,不是矛盾;兩篇的記憶種類、訓練與時間點都不同。
- Felsenberg 2018 的 PPL1 實驗缺允許溫度對照(該來源頁 3.1 第 4 點)。
相關
- 品系:e-split-gal4、e-r58e02、e-mb099c
- 細胞:e-dopaminergic-neuron、e-ppl1-gamma1pedc、e-ppl1-gamma2alpha1
- 工具:e-shibire-ts、e-cschrimson
- 概念與主題:c-memory-extinction、t-memory-updating、t-timing-rules;矛盾:syn-contradictions
- 來源:s-handler-2019-dopamine-receptor-timing、s-felsenberg-2017-re-evaluation、s-felsenberg-2018-memory-extinction
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記憶消退(memory extinction) 多巴胺神經元(dopaminergic neuron, DAN) MB099C 驅動品系(MB099C split-GAL4) PPL1-γ1pedc 多巴胺神經元(PPL1-γ1pedc, MB-MP1) PPL1-γ2α′1 多巴胺神經元(PPL1-γ2α′1, MB-MV1) R58E02 驅動品系(R58E02 driver lines) 溫度敏感型阻斷工具(shibire^ts1) split-GAL4 驅動品系(split-GAL4 driver lines) TH-GAL4 與 TH+DDC 驅動(TH-GAL4 and TH/DDC drivers) 索引 Felsenberg 2017 · re evaluation Felsenberg 2018 · memory extinction 輸出神經元回頭指揮多巴胺神經元:MBON→DAN 回饋迴路 記憶怎麼被改寫:消退、再鞏固與新舊記憶並存 先後與間隔:氣味和多巴胺的時序如何決定學到什麼
記憶消退(memory extinction) 多巴胺神經元(dopaminergic neuron, DAN) MB099C 驅動品系(MB099C split-GAL4) PPL1-γ1pedc 多巴胺神經元(PPL1-γ1pedc, MB-MP1) PPL1-γ2α′1 多巴胺神經元(PPL1-γ2α′1, MB-MV1) R58E02 驅動品系(R58E02 driver lines) 溫度敏感型阻斷工具(shibire^ts1) split-GAL4 驅動品系(split-GAL4 driver lines) TH-GAL4 與 TH+DDC 驅動(TH-GAL4 and TH/DDC drivers) 索引 Felsenberg 2017 · re evaluation Felsenberg 2018 · memory extinction 輸出神經元回頭指揮多巴胺神經元:MBON→DAN 回饋迴路 記憶怎麼被改寫:消退、再鞏固與新舊記憶並存 先後與間隔:氣味和多巴胺的時序如何決定學到什麼